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日記

時事ネタやいろいろなことを気ままに書くかもです

化学物質って電子顕微鏡とかじゃなくて

24/04/01(月)18:27:15No.1173864007+ 20:03頃消えます
1711963635807.png

化学物質って電子顕微鏡とかじゃなくて
なんかこういう分析機のグネグネしたデータを見て「多分こういう感じの物質が入ってる」って予測するだけなんだな…
なんかもっとこうハイテクなイメージがあった

24/04/01(月)18:28:47No.1173864470+

見たものしか信じられない人?

… 224/04/01(月)18:29:19No.1173864647+

>見たものしか信じられない人?
見えない物を見ようとして

… 324/04/01(月)18:31:06No.1173865216+

実際見たわけじゃ無いのによく断定できるよなとは思う

… 424/04/01(月)18:33:54No.1173866116そうだねx6

X線で結晶構造解析する方法もあるよ

… 524/04/01(月)18:34:41No.1173866370そうだねx6

でもそのグネグネしたデータを出すのに使うのが核磁気共鳴って技術だよ
名前からしてすごいハイテク

… 624/04/01(月)18:39:02No.1173867848そうだねx2

構造にルールがあって想像が可能で他に余地がないならグネグネでも十分であろう
単に構造を視覚化するところまでプログラミングしてないだけの話

… 724/04/01(月)18:41:28No.1173868654そうだねx3

これめちゃくちゃ苦手だわ
炭素が●個あるっぽいからたぶん●●で~
このグラフのこの部分は二重結合があるっぽいからたぶん芳香環で~みたいな
今はAIとかがもうちょっと楽になってるのかな

… 824/04/01(月)18:43:02No.1173869159+

大学教授レベルになるとピークの位置について調べなくてもスペクトルだけで化合物の同定ができるらしい

… 924/04/01(月)18:43:26No.1173869291+

>これめちゃくちゃ苦手だわ
>炭素が●個あるっぽいからたぶん●●で~
>このグラフのこの部分は二重結合があるっぽいからたぶん芳香環で~みたいな
>今はAIとかがもうちょっと楽になってるのかな
プロは「これプベルル酸入ってますね」とかパッと見でわかるもんなの?

… 1024/04/01(月)18:45:53No.1173870083+

これ苦手すぎて生物系の研究室行ったわ

… 1124/04/01(月)18:48:17No.1173870793+

>>これめちゃくちゃ苦手だわ
>>炭素が●個あるっぽいからたぶん●●で~
>>このグラフのこの部分は二重結合があるっぽいからたぶん芳香環で~みたいな
>>今はAIとかがもうちょっと楽になってるのかな
>プロは「これプベルル酸入ってますね」とかパッと見でわかるもんなの?
わからない
だから会見でも「プベルル酸がたぶん一番可能性が高いと思います」みたいな言い方をしてる

… 1224/04/01(月)18:49:46No.1173871240+

今AIの研究が進行中だから多分ちょっとたったら劇的に変わってそう

… 1324/04/01(月)18:50:03No.1173871323+

>これ苦手すぎて生物系の研究室行ったわ
生物系も使うぞ

… 1424/04/01(月)18:51:55No.1173871948+

こういうスペクトルってどうやって決まるの?

… 1524/04/01(月)18:52:17No.1173872085そうだねx1

>わからない
>だから会見でも「プベルル酸がたぶん一番可能性が高いと思います」みたいな言い方をしてる
俺も分析化学脱落した負け犬その2なんだけど
完全に同定するためには単離してX線構造解析かガスクロかけるんだっけ?

… 1624/04/01(月)18:52:28No.1173872148+

プベルル酸の標本があればパターンが一致するので同定はできる
ただマイナー物質すぎて化学合成による大量生産もできてないので研究も進んでない感じっぽい
なんだよ7炭素環なんて…まじ意味わかんない…

… 1724/04/01(月)18:56:40No.1173873599+

NMRとかMSからするとプベルル酸っぽいけど可能性が高いだけだから明言できない
ならわかるけど
プベルル酸のイメージが悪くなるから…って言い訳はどうかと思ったよ
だれが知ってるんだよそんな物質

… 1824/04/01(月)18:57:07No.1173873747+

>見えない物を見ようとして
見てほしくないものだけ見る!!

… 1924/04/01(月)18:57:52No.1173874049+

でも楽しかったなこれ
学部卒だからかもしれない

… 2024/04/01(月)18:58:57No.1173874476+

スペクトルのピークの位置って左図みたいな構造から推定できるものなんです?

… 2124/04/01(月)18:59:24No.1173874647+

>こういうスペクトルってどうやって決まるの?
スペクトル分析機が答えを出す

… 2224/04/01(月)18:59:50No.1173874806+

>>見えない物を見ようとして
>見てほしくないものだけ見る!!
はぁ~フェンコンカルコンフェンコンカルコン!

24/04/01(月)19:01:51No.1173875629+

気化させたり液に溶かしたりして励起スペクトル見る方法もいいぞ

… 2524/04/01(月)19:03:09No.1173876104+

>見たものしか信じられない人?
今マッハの悪口言った?

… 2624/04/01(月)19:03:16No.1173876143+

>スペクトルのピークの位置って左図みたいな構造から推定できるものなんです?
出来るけどやっぱり誤差があるので
最後は人の手が必要

… 2724/04/01(月)19:03:17No.1173876153+

もう一生見たくないこのグラフ
俺が合成した物質は絶対めちゃくちゃになるんだもん

… 2824/04/01(月)19:03:22No.1173876191+

見える見える

… 2924/04/01(月)19:04:15No.1173876549+

>なんかもっとこうハイテクなイメージがあった
NMRとかの構造同定に使う技術以上にハイテクな技術もこの世にそうそうないよ…
そのハイテクさを味わうにも物理や数学の知識が必要なんだけど

… 3024/04/01(月)19:04:28No.1173876619+

目に見えないものを無理矢理可視化してるからミスも多い
だからコントロールが大事な訳ですね

… 3124/04/01(月)19:04:30No.1173876634+

>X線で結晶構造解析する方法もあるよ
じゃあ結晶化しようねえ…

… 3224/04/01(月)19:05:03No.1173876866+

高校化学得意だったのに脱落したのはNMR読めないからだ

… 3324/04/01(月)19:05:41No.1173877076+

>もう一生見たくないこのグラフ
>俺が合成した物質は絶対めちゃくちゃになるんだもん
君は作業が雑!

… 3424/04/01(月)19:05:59No.1173877201+

プロトンの数が1個とか2個とかならわかるよ
0.5個とか1.25個とかが平然と出てくるなんなんだよ

… 3524/04/01(月)19:06:34No.1173877425+

あたり付けたらそれだけ抽出できたりするのかな

… 3624/04/01(月)19:06:47No.1173877498+

今のところカビに合成してもらうしか無い物質なので
標本なんかあるわけがないのである

… 3724/04/01(月)19:07:05No.1173877631+

第二次大戦期のレーダー手みたいなことやってたのか

… 3824/04/01(月)19:07:27No.1173877766+

今はalphafold2があるからタンパク質の構造もAIで予測出来るようになったよ!
ファンデルワールス力は計算に入れてないから天然変性領域は予測できないけど

… 3924/04/01(月)19:07:53No.1173877934+

いや別に合成できないわけじゃないよ
研究の対象になってないから大量生産されてないだけ

… 4024/04/01(月)19:08:15No.1173878104+

>今のところカビに合成してもらうしか無い物質なので
>標本なんかあるわけがないのである
全合成の論文たしかあるよ
類縁体も合成されてる

… 4124/04/01(月)19:08:18No.1173878123+

>>X線で結晶構造解析する方法もあるよ
>じゃあ結晶化しようねえ…
気軽に一大プロジェクト立ち上げるな

… 4224/04/01(月)19:08:52No.1173878364+

プベルル酸の結晶とか理研しか作れないんじゃなかろうか

… 4324/04/01(月)19:09:38No.1173878667+

既報なんだからスペクトルのピーク載ってるのと一致してればいいだろ
不斉も無いからそうそう間違ってる事もない筈

… 4424/04/01(月)19:11:34No.1173879459そうだねx3

なんか知らん物質でも研究してくれてたおかげってわけか…

… 4524/04/01(月)19:11:55No.1173879596+

>第二次大戦期のレーダー手みたいなことやってたのか
まさか大学生になってから急にパズルゲームやらされることになるとは思わなかったよ
今は違うんだろうけど本当につい最近まで人間がパズルと経験則でやってた

… 4624/04/01(月)19:12:08No.1173879678+

目には見えないけどキャベツ食べるとビタミンが体に入る
結果がすべてだ

… 4724/04/01(月)19:13:32No.1173880229+

>今はalphafold2があるからタンパク質の構造もAIで予測出来るようになったよ!
DiffusionModelで構造を扱えるって聞いたことあるけどどうやるんだろうな…

… 4824/04/01(月)19:14:57No.1173880848+

既知の物質のピーク全部記録してあって候補から自動的に〇%でこの物質ですね…ってやってくれるソフトないの?

… 5024/04/01(月)19:16:33No.1173881478+

>既知の物質のピーク全部記録してあって候補から自動的に〇%でこの物質ですね…ってやってくれるソフトないの?
そういうのならAIとか関係なく作れそうだけどな

… 5124/04/01(月)19:16:47No.1173881559+

これくらいの分子なら割と簡単に構造決定できるよ

… 5224/04/01(月)19:17:09No.1173881687+

>既知の物質のピーク全部記録してあって候補から自動的に〇%でこの物質ですね…ってやってくれるソフトないの?
一部の解析装置ではライブラリデータと照合あるけど…

… 5324/04/01(月)19:18:49No.1173882322+

ライブラリーは高くてな…
それに全部を網羅してる物はない

… 5424/04/01(月)19:19:25No.1173882566+

ペロッ…この味はプベルル酸!
みたいな職人芸じゃないんだ…

… 5524/04/01(月)19:19:26No.1173882573+

最強のライブラリーは人間だよ

… 5624/04/01(月)19:19:27No.1173882576+

天文学もだいたいこんなだよな

… 5724/04/01(月)19:19:50No.1173882730+

最終的には人の目頼りだったのか…

… 5824/04/01(月)19:20:35No.1173883017+

質量分析は全てを解決するし…

… 5924/04/01(月)19:21:28No.1173883358+

>天文学もだいたいこんなだよな
でっかい望遠鏡で見たりするんじゃないんだ…

… 6024/04/01(月)19:22:22No.1173883721+

これトロポン系で芳香族性あるからHNMRだと低磁場シフトするのかな

… 6124/04/01(月)19:23:02No.1173884004+

プベルル酸だけ単離したらそれを同定するのは簡単だろうけど
どうやって単離するか・単離できたと保証するのかは難しくない?
研究室で合成した物質でもないし

… 6224/04/01(月)19:23:35No.1173884198+

>これトロポン系で芳香族性あるからHNMRだと低磁場シフトするのかな
ヒでNMR貼られてるの見たけど7ぐらいにシングレット一本だけでてた
クソゲーすぎた

… 6324/04/01(月)19:24:23No.1173884555+

spring8とかの加速器使う分析方法はなんていうのー?

… 6424/04/01(月)19:25:02No.1173884827+

結合って見えないんだ
まあそうだよな

… 6524/04/01(月)19:25:20No.1173884945+

>プベルル酸の結晶とか理研しか作れないんじゃなかろうか
こいつは平面性と融点かなり高いから割と素直に結晶化してくれそうな雰囲気はある

… 6624/04/01(月)19:25:59No.1173885210+

>ヒでNMR貼られてるの見たけど7ぐらいにシングレット一本だけでてた
>クソゲーすぎた
7だとベンゼンとかとほぼ同じかあ

… 6724/04/01(月)19:26:31No.1173885439+

生体作用の分析はまた別なのね

… 6824/04/01(月)19:26:40No.1173885494+

気軽に結晶化できる方法ないかな…ないよね…

… 6924/04/01(月)19:27:38No.1173885896+

ひたすらXPSやらXRDやらとってた思い出が蘇ってきた

… 7024/04/01(月)19:27:40No.1173885912+

たんぱく質よりかは結晶化楽だとは思う

24/04/01(月)19:28:29No.1173886249+

>ヒでNMR貼られてるの見たけど7ぐらいにシングレット一本だけでてた
>クソゲーすぎた
なるほどわからん
fu3303975.jpg

24/04/01(月)19:29:25No.1173886638+

よく見れば7員環は対称構造なのか

… 7324/04/01(月)19:30:02No.1173886878+

錯体にすると結構綺麗に結晶出来たりするよね
ぺらっぺらのとかほっそいのできることもあったけど…

… 7424/04/01(月)19:30:06No.1173886903+

結構安定してそうな構造してない?

… 7524/04/01(月)19:30:46No.1173887183+

HMBCとHMQCのスペクトルもくれ

… 7624/04/01(月)19:31:00No.1173887274+

>よく見れば7員環は対称構造なのか
6とかだと違うんですか?

… 7724/04/01(月)19:31:02No.1173887286+

七員環化合物って言うらしいね

… 7824/04/01(月)19:31:41No.1173887561+

>よく見れば7員環は対称構造なのか
便宜上ケトンが5位にいるけどおそらくこいつかなりカルボニルが分極してるから3~6位のどこにいてもおかしくはない

… 7924/04/01(月)19:35:07No.1173888951+

>なんだよ7炭素環なんて…まじ意味わかんない…
そのうえ芳香族!

… 8024/04/01(月)19:36:34No.1173889576+

製薬会社にいる人なら多分見当付くんだろうな

… 8124/04/01(月)19:36:58No.1173889750+

問題は今まで見つけたことがない変な謎分子だったとき
さぁ結晶を作るのだ…!

… 8224/04/01(月)19:37:01No.1173889769+

puberulic acidでCCDC検索かけたら結晶は単離されてないのね

… 8324/04/01(月)19:37:38No.1173890033+

>>よく見れば7員環は対称構造なのか
>便宜上ケトンが5位にいるけどおそらくこいつかなりカルボニルが分極してるから3~6位のどこにいてもおかしくはない
そういう場合液体窒素とかで冷やせばいいのかね

… 8424/04/01(月)19:38:15No.1173890297+

普通にベンゼン環だったらふーnて感じだった
なんか違和感あると思ったら六角形じゃない…!

24/04/01(月)19:39:04No.1173890655+

fu3303975.jpg

カルボン酸の水素ってもっと低磁場のイメージあったな
溶媒とかにも因るか

24/04/01(月)19:39:21No.1173890774+

>そういう場合液体窒素とかで冷やせばいいのかね
どうだろう
そういう場合もあるけど正直こいつの場合低温測定でもあんま変わんないような気がしなくもない

… 8724/04/01(月)19:40:08No.1173891083そうだねx1

>カルボン酸の水素ってもっと低磁場のイメージあったな
>溶媒とかにも因るか
右2つは溶媒ピークだよ

… 8824/04/01(月)19:41:00No.1173891437+

7員環で対称とかでなくてπ電子が10だから非局在化してる

… 8924/04/01(月)19:41:17No.1173891552+

>右2つは溶媒ピークだよ
ああ重メタノールかこれ

… 9024/04/01(月)19:41:56No.1173891823+

分からない話をしている…!

… 9124/04/01(月)19:42:05No.1173891885+

>7員環で対称とかでなくてπ電子が10だから非局在化してる
シングレット一本になるのは非局在したうえで2つのC-Hが対称な位置にあるからじゃないの?

… 9224/04/01(月)19:42:08No.1173891905+

IRくらいしか使わないけどNMRと組み合わせて使えばもっと同定できないのかね?
サンプル量少なすぎて無理?

24/04/01(月)19:42:16No.1173891965+

fu3304032.jpg

>6とかだと違うんですか?
ぱっと見は対称性がないように見えるんだけどこの赤線を軸として左右に対称な分子なんだ

24/04/01(月)19:43:04No.1173892301+

>シングレット一本になるのは非局在したうえで2つのC-Hが対称な位置にあるからじゃないの?
なので前提条件は「7員環」の対称性じゃないよと言う話

… 9524/04/01(月)19:43:58No.1173892641+

好みな形の分子だけどこんなことになっていっぱい悲しい…

… 9624/04/01(月)19:44:34No.1173892930+

>IRくらいしか使わないけどNMRと組み合わせて使えばもっと同定できないのかね?
>サンプル量少なすぎて無理?
この場合IRに頼らずともOHやC=O、ついでに芳香族の存在は薄々察しはつくはずだから…
そっから七員環芳香族にたどり着くのは相当苦戦するけど

… 9724/04/01(月)19:44:59No.1173893137+

どっちがXRFでどっちがXRDかもう忘れたわ

… 9824/04/01(月)19:45:12No.1173893220+

>この場合IRに頼らずともOHやC=O、ついでに芳香族の存在は薄々察しはつくはずだから…
つかねえだろ!?

… 9924/04/01(月)19:46:00No.1173893660+

LCで見つけたそうだからLC/MSで分子量から推定したんじゃなかろうか

… 10024/04/01(月)19:46:05No.1173893694+

ディールズアルダー反応とかあったな

… 10124/04/01(月)19:46:06No.1173893700+

>つかねえだろ!?
8ppmは芳香族を疑うんじゃねえかな

https://img.2chan.net/b/res/1173864007.htm

テーマ:健康食品 サプリメント - ジャンル:ヘルス・ダイエット

  1. 2024/04/02(火) 00:14:51|
  2. ふたば
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